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大正9年(1920年)に内務省の栄養研究所として誕生。国民の栄養・食生活の改善及び健康増進や栄養学の進歩に大きく貢献。平成13年4月1日より、政府の行政改革の方針に基づいて、当研究所は、「独立行政法人国立健康・栄養研究所」となり、国民の健康の保持・増進及び栄養・食生活に関する調査・研究を行うことにより、公衆衛生の向上及び増進を図る公的機関としての役割を与えられている。